W tej pracy przedstawiono dwa podstawowe aminokwasy, glicynę (Gly) i alaninę (Ala).Dzieje się tak głównie dlatego, że mogą działać jako aminokwasy zasadowe, a dodanie do nich grup może generować inne rodzaje aminokwasów.
Glicyna ma szczególny słodki smak, dlatego jej angielska nazwa pochodzi od greckiego glykys (słodki).Chińskie tłumaczenie glicyny ma nie tylko znaczenie „słodki”, ale ma również podobną wymowę, którą można nazwać wzorem „wierności, osiągnięć i elegancji”.Ze względu na słodki smak glicyna jest często stosowana jako środek aromatyzujący w przemyśle spożywczym w celu usunięcia goryczy i zwiększenia słodkości.Łańcuch boczny glicyny jest mały i zawiera tylko jeden atom wodoru.To go wyróżnia.Jest to aminokwas zasadowy bez chiralności.
Glicyna występująca w białkach charakteryzuje się niewielkimi rozmiarami i elastycznością.Na przykład konformacja trójniciowej helisy kolagenu jest bardzo szczególna.Na każde dwie reszty musi przypadać jedna glicyna, w przeciwnym razie spowoduje to zbyt dużą zawadę przestrzenną.Podobnie połączenie między dwiema domenami białka często wymaga glicyny, aby zapewnić elastyczność konformacyjną.Jeśli jednak glicyna jest wystarczająco elastyczna, jej stabilność jest z konieczności niewystarczająca.
Glicyna jest jednym ze spoilerów podczas tworzenia α-helisy.Powodem jest to, że łańcuchy boczne są zbyt małe, aby w ogóle ustabilizować konformację.Ponadto glicynę często wykorzystuje się do przygotowania roztworów buforowych.Ci z Was, którzy zajmują się elektroforezą, często to pamiętają.
Angielska nazwa alaniny pochodzi od niemieckiego aldehydu octowego, a chińska nazwa jest łatwiejsza do zrozumienia, ponieważ alanina zawiera trzy atomy węgla, a jej nazwa chemiczna to alanina.Jest to prosta nazwa, podobnie jak charakter aminokwasu.Łańcuch boczny alaniny ma tylko jedną grupę metylową i jest nieco większy niż łańcuch glicyny.Kiedy rysowałem wzory strukturalne pozostałych 18 aminokwasów, dodałem grupy do alaniny.W białkach alanina jest jak cegła, powszechny podstawowy materiał budowlany, który z nikim nie koliduje.
Łańcuch boczny alaniny ma niewielkie przeszkody i znajduje się w α-helisie, która jest konformacją.Jest również bardzo stabilny po złożeniu β.W inżynierii białek, jeśli chcesz zmutować aminokwas bez określonego celu w białku, ogólnie możesz zmutować go do alaniny, co nie jest łatwe do zniszczenia ogólnej konformacji białka.
Czas publikacji: 29 maja 2023 r