W tym artykule wprowadzono dwa podstawowe aminokwasy, glicynę (GLY) i alanina (ALA). Wynika to głównie z tego, że mogą działać jako aminokwasy podstawowe, a dodanie do nich grup może generować inne rodzaje aminokwasów.
Glicyna ma specjalny słodki smak, więc jej angielska nazwa pochodzi od greckich Glykys (słodkich). Chińskie tłumaczenie glicyny ma nie tylko znaczenie „słodkiego”, ale także ma podobną wymowę, którą można nazwać modelem „wierności, osiągnięć i elegancji”. Ze względu na słodki smak glicyna jest często stosowana jako środek aromatyzujący w przemyśle spożywczym w celu usunięcia goryczy i zwiększenia słodyczy. Łańcuch boczny glicyny jest mały z tylko jednym atomem wodoru. To czyni go innym. Jest to podstawowy aminokwas bez chiralności.
Glicyna w białkach charakteryzuje się jej niewielkim rozmiarem i elastycznością. Na przykład trójniciowa konformacja helisy kolagenu jest wyjątkowa. Musi być jedna glicyna na każde dwa reszty, w przeciwnym razie spowoduje to zbyt dużą przeszkodę. Podobnie, powiązanie między dwiema domenami białka często wymaga glicyny w celu zapewnienia elastyczności konformacyjnej. Jeśli jednak glicyna jest wystarczająco elastyczna, jej stabilność jest koniecznie niewystarczająca.
Glicyna jest jednym z spoilerów podczas tworzenia helisy α. Powodem jest to, że łańcuchy boczne są zbyt małe, aby w ogóle ustabilizować konformację. Ponadto glicyna jest często stosowana do przygotowania roztworów buforowych. Ci z was, którzy robią elektroforeza, często to pamiętają.
Angielska nazwa Alanine pochodzi od niemieckiego aldehydu aldehydowego, a chińska nazwa jest łatwiejsza do zrozumienia, ponieważ alanina zawiera trzy węgle, a jej chemiczna nazwa to Alanine. Jest to prosta nazwa, podobnie jak charakter aminokwasu. Łańcuch boczny alaniny ma tylko jedną grupę metylową i jest nieco większy niż w przypadku glicyny. Kiedy narysowałem wzory strukturalne dla pozostałych 18 aminokwasów, dodałem grupy do alaniny. W białkach alanina jest jak cegła, wspólny podstawowy materiał budowlany, który nie koliduje z nikim.
Łańcuch boczny alaniny ma niewielką przeszkodę i znajduje się w helisie α, która jest konformacją. Jest to również bardzo stabilne, gdy β-FOLD. W inżynierii białek, jeśli chcesz muzować aminokwas bez specyficznego celu na białku, ogólnie możesz mu zmutować do alaniny, co nie jest łatwe do zniszczenia ogólnej konformacji białka.
Czas postu: 2025-07-02